MTProto، یک پروتکل امنیتی جدید است که با هدف عبور از موانع فیلترینگ توسط تیم توسعه دهنده تلگرام ایجاد شده است. هم اکنون نسخه های جدیدتری از این پروتکل موجود است.

MTProto پروتکلی برای انتقال داده ها بصورت رمزنگاری شده و کاربر-به-کاربر یا همان end-to-end است که به دلیل امنیت و سرعت انتقال بالا شناخته‌شده است.

از مزایای MTProto تبادل کلید دیفی هلمن (Diffie–Hellman Key Exchange)، الگوریتم هش SHA-256، استاندارد رمزنگاری پیشرفته AES، و استانداردهایی همچون AES IGE و AES IGE IV (که صرفا توسط خود تلگرام استفاده و توسعه می‌پذیرند) می‌باشد. نکته قابل توجه در این پروتکل قابلیت استفاده از هر سه نوع پروتکل درگاه شامل UDP, TCP و HTTPS است.